【前回までのあらずじ】ガンハザード編
ホセは兵器工場をもつソサエティの幹部だった。そのホセの護衛についたジェノスと対峙する間に輸送機で逃走を図るホセ、急いで追うしょうさん。行く手にはジェノスの部下、ルークとビショップが立ちはだかる。二人を突破し上空のホセを追う。
輸送機はしょうさんらにより撃墜され、この責任と兵器工場の陥落の責任を取るためホセは近衛部隊に始末される。そしてホセについていたジェノスはついにソサエティへと迎えらえる。
しょうさんらは、ソサエティの本拠地を探すためアニタらガーディアンとともに同じく南米エスポルテにて探索活動を開始。ソサエティは早くも軍備を既に整え、ソサエティとガーディアンの戦いは始まっていた。その戦火の中にしょうさんも飛び込んでゆく。
＜専門用語＞
ヴァンツァー:原則二足歩行型の戦闘ロボット。
キャリアー：ヴァンツァーやパイロット、物資などを収容して戦場を航行する航空機。
ソサエティ：各地の異常とも言える紛争を裏で操っていると言われている謎の組織。